Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCOLCEQ15113 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms