Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms