Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FRMPD4Q14CM0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FRMPD4Q14CM0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms