Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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COL19A1Q14993 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL19A1Q14993 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL19A1Q14993 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL19A1Q14993 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COL19A1Q14993 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL19A1Q14993 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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COL19A1Q14993 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL19A1Q14993 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL19A1Q14993 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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COL19A1Q14993 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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COL19A1Q14993 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL19A1Q14993 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL19A1Q14993 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL19A1Q14993 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL19A1Q14993 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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COL19A1Q14993 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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COL19A1Q14993 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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COL19A1Q14993 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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COL19A1Q14993 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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COL19A1Q14993 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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COL19A1Q14993 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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COL19A1Q14993 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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COL19A1Q14993 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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