Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RRP1BQ14684 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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