Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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