Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms