Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCOA4Q13772 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCOA4Q13772 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCOA4Q13772 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCOA4Q13772 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCOA4Q13772 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCOA4Q13772 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCOA4Q13772 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCOA4Q13772 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCOA4Q13772 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCOA4Q13772 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCOA4Q13772 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCOA4Q13772 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCOA4Q13772 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NCOA4Q13772 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCOA4Q13772 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NCOA4Q13772 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCOA4Q13772 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCOA4Q13772 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCOA4Q13772 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCOA4Q13772 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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