Protein–RNA interactions for Protein: Q13686

ALKBH1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH1Q13686 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALKBH1Q13686 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms