Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms