Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMS2P3Q13401 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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