Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

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Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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NR5A1Q13285 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
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NR5A1Q13285 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR5A1Q13285 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms