Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ERCC8Q13216 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ERCC8Q13216 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ERCC8Q13216 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ERCC8Q13216 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ERCC8Q13216 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ERCC8Q13216 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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