Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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TRAF3Q13114 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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TRAF3Q13114 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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TRAF3Q13114 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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TRAF3Q13114 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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TRAF3Q13114 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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