Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms