Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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