Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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