Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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