Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD3Q0VAK6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms