Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNA1Q09470 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms