Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms