Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms