Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms