Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX8Q06710 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX8Q06710 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX8Q06710 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX8Q06710 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX8Q06710 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX8Q06710 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX8Q06710 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PAX8Q06710 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX8Q06710 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX8Q06710 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX8Q06710 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PAX8Q06710 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX8Q06710 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX8Q06710 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PAX8Q06710 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX8Q06710 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX8Q06710 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX8Q06710 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX8Q06710 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX8Q06710 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX8Q06710 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms