Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX1Q04741 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms