Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PPARDQ03181 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PPARDQ03181 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PPARDQ03181 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PPARDQ03181 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PPARDQ03181 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PPARDQ03181 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PPARDQ03181 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PPARDQ03181 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PPARDQ03181 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PPARDQ03181 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PPARDQ03181 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PPARDQ03181 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PPARDQ03181 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PPARDQ03181 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PPARDQ03181 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PPARDQ03181 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PPARDQ03181 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PPARDQ03181 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPARDQ03181 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms