Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms