Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms