Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD1P98174 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD1P98174 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD1P98174 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD1P98174 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD1P98174 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGD1P98174 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGD1P98174 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGD1P98174 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD1P98174 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD1P98174 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD1P98174 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD1P98174 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD1P98174 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD1P98174 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD1P98174 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD1P98174 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD1P98174 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD1P98174 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD1P98174 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD1P98174 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD1P98174 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD1P98174 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD1P98174 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD1P98174 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD1P98174 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD1P98174 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD1P98174 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD1P98174 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD1P98174 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD1P98174 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD1P98174 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms