Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms