Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB1P62873 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB1P62873 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GNB1P62873 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GNB1P62873 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GNB1P62873 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms