Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VBP1P61758 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VBP1P61758 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VBP1P61758 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms