Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXYD4P59646 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXYD4P59646 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms