Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA9P57773 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA9P57773 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA9P57773 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA9P57773 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms