Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERFP50548 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERFP50548 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERFP50548 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms