Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms