Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms