Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA3P42263 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms