Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5CP41229 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5CP41229 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5CP41229 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5CP41229 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5CP41229 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5CP41229 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5CP41229 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5CP41229 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KDM5CP41229 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5CP41229 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5CP41229 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5CP41229 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5CP41229 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5CP41229 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5CP41229 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5CP41229 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5CP41229 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KDM5CP41229 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5CP41229 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5CP41229 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5CP41229 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5CP41229 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5CP41229 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5CP41229 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5CP41229 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5CP41229 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5CP41229 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5CP41229 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5CP41229 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5CP41229 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KDM5CP41229 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5CP41229 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5CP41229 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5CP41229 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5CP41229 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5CP41229 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5CP41229 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5CP41229 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5CP41229 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5CP41229 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5CP41229 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KDM5CP41229 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5CP41229 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KDM5CP41229 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KDM5CP41229 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KDM5CP41229 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KDM5CP41229 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5CP41229 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5CP41229 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5CP41229 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5CP41229 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5CP41229 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KDM5CP41229 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5CP41229 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5CP41229 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KDM5CP41229 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KDM5CP41229 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5CP41229 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5CP41229 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5CP41229 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KDM5CP41229 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5CP41229 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5CP41229 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5CP41229 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5CP41229 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5CP41229 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5CP41229 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5CP41229 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5CP41229 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5CP41229 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5CP41229 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KDM5CP41229 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
KDM5CP41229 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
KDM5CP41229 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.51■■■□□ 2
KDM5CP41229 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
KDM5CP41229 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms