Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM3P40198 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM3P40198 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM3P40198 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM3P40198 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM3P40198 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM3P40198 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM3P40198 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM3P40198 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM3P40198 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms