Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6V1E1P36543 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms