Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RCVRNP35243 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms