Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGER1P34995 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms