Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSG3P32926 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSG3P32926 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DSG3P32926 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DSG3P32926 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DSG3P32926 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DSG3P32926 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DSG3P32926 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DSG3P32926 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSG3P32926 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DSG3P32926 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSG3P32926 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSG3P32926 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DSG3P32926 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DSG3P32926 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DSG3P32926 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSG3P32926 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSG3P32926 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DSG3P32926 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DSG3P32926 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DSG3P32926 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSG3P32926 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DSG3P32926 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DSG3P32926 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSG3P32926 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DSG3P32926 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSG3P32926 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSG3P32926 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DSG3P32926 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSG3P32926 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DSG3P32926 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DSG3P32926 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSG3P32926 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DSG3P32926 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DSG3P32926 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DSG3P32926 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
DSG3P32926 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DSG3P32926 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DSG3P32926 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DSG3P32926 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DSG3P32926 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DSG3P32926 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSG3P32926 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSG3P32926 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSG3P32926 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSG3P32926 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSG3P32926 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DSG3P32926 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSG3P32926 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DSG3P32926 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSG3P32926 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DSG3P32926 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DSG3P32926 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DSG3P32926 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DSG3P32926 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DSG3P32926 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DSG3P32926 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DSG3P32926 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DSG3P32926 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DSG3P32926 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DSG3P32926 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DSG3P32926 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms