Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms