Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRABP1P29762 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms