Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD34P28906 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD34P28906 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms