Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms