Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFKBIAP25963 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms