Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms